Fakulta zemědělská a technologická JU (FZT JU) byla založena v roce 1960. V roce 1991 stála, jako jedna ze dvou zakládajících fakult u zrodu Jihočeské univerzity. Spojuje v sobě zemědělskou tradici regionu s moderním výzkumem mezinárodního formátu. Od svého vzniku vychovala tisíce úspěšných odborníků pro zemědělskou praxi, státní správu či akademický sektor. Je zapojena do mezinárodních projektů a její studenti se účastní zahraničních stáží na špičkových zahraničních pracovištích po celém světě. Fakulta sídlí v několika budovách v areálu kampusu.

Pro studenty s ukončeným středoškolským vzděláním (maturitou) je výchozím stupněm široká nabídka bakalářského studia. Jeho absolventi mohou následně pokračovat v řadě studijních programů navazujícího magisterského studia a získat inženýrský titul. Na fakultě si lze rovněž vybrat z celé řady doktorských studijních programů pro zájemce o nejvyšší stupeň akademického vzdělání.

FZT JU dlouhodobě a intenzivně spolupracuje s podnikatelským sektorem. Napomáhá tím propojení teoretické části výuky s praxí. Převážná většina výzkumných aktivit fakulty je orientována na aplikovaný výzkum s výrazným přínosem pro společnost. Ze zajímavých projektů v této oblasti lze uvést například experimentální fakultní minipivovar, Mezinárodní školicí a výzkumné centrum společnosti DeLaval nebo Centrum pro nejlepší dostupné techniky pro intenzivní chovy hospodářských zvířat (BAT centrum JU).