Ekonomická fakulta klade důraz na rozvoj moderních forem vzdělávání posilujících praktické dovednosti absolventů, jako je projektová výuka a zapojení studentů do vědy a výzkumu. Pro aktivní studenty nabízíme možnost stínování manažerů nebo stáží ve významných podnicích. Rozvíjí také intenzivní spolupráci s firmami a institucemi nejen v regionu jižních Čech. Klíčová je pro fakultu zahraniční spolupráce, která aktivně probíhá například s francouzskou Université de Bretagne-Sud, Westsächsische Hochschule Zwickau, University of Missouri, nebo také s univerzitami v Pasově a Linci.
Věda a výzkum na Ekonomické fakultě se zaměřuje zejména na témata související s ekonomikou a řízením podniků a socioekonomickými faktory rozvoje regionů. Zabývá se také aplikovaným výzkumem a ve spolupráci s významnými podniky a institucemi v regionu řeší ekonomické problémy v praxi s využitím nejnovějších ekonomicko-matematických metod a modelů. Nově se rozvíjí studium problematiky environmentální ekonomiky, respektive zelené ekonomie a bioekonomie, jako významný směr inovačních procesů v zemích Evropské unie.
Ekonomická fakulta vznikla v roce 2007 a navazuje na tradici ekonomického vysokoškolského vzdělávání v Českých Budějovicích, které se začalo rozvíjet už v 60. letech minulého století. Od doby svého vzniku zaznamenala řadu úspěchů v oblasti vědy a výzkumu. Studentům nabízí všechny stupně vysokoškolského studia v prezenční i kombinované formě. Její absolventi mají podle dlouhodobých statistik vysokou šanci uplatnit se na trhu práce.